Analysis: A_clcad2_test
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Summary
Effect | Benign | Likely benign | VOUS | Likely pathogenic | Pathogenic | Not Classified | Total |
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inframe | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 2 |
nonsynonymous | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 52 | 52 |
synonymous | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 83 | 83 |
Not specified | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 37 | 37 |
Total | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 174 | 174 |
Variant List
-
Export
Genes | Position | Ref | Patient | Read Depth | Type | Location | Transcript | Effect | Exon | c. | p. | Classification | Confirmed Classification | References | Similarities | Info | Report | Actions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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TNNT2 | 1:201,341,176-201,341,180 | AGAAG | AGAAG | . | 281
|
deletion | intronic | NM_001276347.1 | 4 | c.53-11_53-7delCTTCT | S O M L |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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ACTN2 | 1:236,882,303 | T | C | 265
|
snp | exonic | NM_001103.3 | synonymous | 3 | c.351T>C | p.Ile117Ile | Likely benign | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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ACTN2 | 1:236,883,421 | C | T | 234
|
snp | exonic | NM_001103.3 | synonymous | 4 | c.378C>T | p.Asn126Asn | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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ACTN2 | 1:236,902,594 | C | G | 162
|
snp | intronic | NM_001278344.1 | 12 | c.253-8C>G | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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RYR2 | 1:237,617,757 | C | T | 248
|
snp | exonic | NM_001035.2 | synonymous | 15 | c.1359C>T | p.Ser453Ser | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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RYR2 | 1:237,711,797 | A | G | 249
|
snp | exonic | NM_001035.2 | synonymous | 26 | c.2973A>G | p.Ser991Ser | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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RYR2 | 1:237,801,770 | T | C | 272
|
snp | exonic | NM_001035.2 | synonymous | 45 | c.6906T>C | p.Leu2302Leu | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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RYR2 | 1:237,863,718 | T | G | 175
|
snp | exonic | NM_001035.2 | synonymous | 65 | c.9318T>G | p.Ser3106Ser | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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RYR2 | 1:237,881,770 | C | T | 251
|
snp | exonic | NM_001035.2 | synonymous | 73 | c.10503C>T | p.Thr3501Thr | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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RYR2 | 1:237,890,437 | C | T | 223
|
snp | exonic | NM_001035.2 | synonymous | 76 | c.10776C>T | p.Ser3592Ser | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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RYR2 | 1:237,957,161 | A | G | 196
|
snp | intronic | NM_001035.2 | 95 | c.13783-6A>G | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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APOB | 2:21,225,113 | A | A | G | 201
|
snp | exonic | NM_000384.2 | nonsynonymous | 29 | c.13181T>C | p.Val4394Ala | O M L |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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APOB | 2:21,225,281 | C | T | 211
|
snp | exonic | NM_000384.2 | nonsynonymous | 29 | c.13013G>A | p.Ser4338Asn | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments
|
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APOB | 2:21,232,195 | G | G | A | 249
|
snp | exonic | NM_000384.2 | synonymous | 26 | c.7545C>T | p.Thr2515Thr | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
|
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Comments
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APOB | 2:21,232,803 | T | C | 219
|
snp | exonic | NM_000384.2 | nonsynonymous | 26 | c.6937A>G | p.Ile2313Val | O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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APOB | 2:21,232,803-21,232,804 | TG | CA | 219
|
substitution | exonic | NM_000384.2 | inframe | 26 | c.6936_6937delCAinsTG | p.Asp2312_Val2313delinsAspVal | O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
|
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Comments
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APOB | 2:21,235,475 | T | C | 222
|
snp | exonic | NM_000384.2 | nonsynonymous | 26 | c.4265A>G | p.Tyr1422Cys | S O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
|
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Comments
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
APOB | 2:21,263,900 | G | G | A | 249
|
snp | exonic | NM_000384.2 | nonsynonymous | 4 | c.293C>T | p.Thr98Ile | S O M L |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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TTN-AS1 | 2:179,413,452 | G | G | A | 342
|
snp | ncRNA_intronic | NR_038272.1 | 7 | c.2043+6364G>A |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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TTN | 2:179,413,452 | G | G | A | 342
|
snp | exonic | NM_001267550.1 | synonymous | 339 | c.92901C>T | p.Ser30967Ser | O M |
Similarities: Classification
Similarities: Confirmed Classification
Similarities: Managed Variant Lists
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Gene Priorization Results
Prioritization score:
Evidence:
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Comments
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